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简约而不简单——32.4分的SCI文章如何诞生的
发布时间:2016-01-27 00:00 文章来源: 作者:
最近,发表于CELL上的一篇文章“Regulation of T Cell Receptor Signaling by DENND1B inTH2 Cells andAllergic Disease”阐述了DENN1B(与哮喘密切相关的基因)在过敏反应中起着重要作用。
其研究方法简单明了,论证思路环环相扣,拥有了优质文章所应该具备的所有特点。
DENN,编码一段400个氨基酸大小的蛋白多肽,是在所有真核细胞中十分保守的一个蛋白结构域。他和Rab家族成员(GTP酶)相互作用,作为这些GTP酶的鸟嘌呤转移因子(GEF)。
DENND1A和DENND1B,均为Rab35-GTPase的GEF,而DENND1C还兼任Rab13-GTPase的激活因子。他们均含有DENN结构域,执行着不同的细胞功能。据报导,DENND1B突变,和“慢性空洞性肺曲菌病”发生发展有关。除此之外,DENND1B还和“儿童哮喘”有关(有较广泛的科学意义)。然而DENND1B其具体的致病机制并不清楚(存在科学问题)。
研究人员利用基因敲出技术敲出了小鼠的DENND1B基因。检测发现,DENND1B敲除小鼠在5周龄-7月龄阶段,免疫细胞数目和组成未曾发生变化,却在7月龄以后脾脏和淋巴结中的调节性/记忆性T细胞数目发生改变。表达DENND1B的DC细胞变化不大,且抗原呈递能力不受影响。祖T细胞细胞数量,细胞分化能力也没有显著变化。
然而,当研究人员将目光聚集到调节性T细胞(Th细胞)时,研究人员发现TH2细胞中炎性因子因子IL-4、IL-5、IL-13合成和分泌量上升。
此外,DENND1B敲除后,可以延迟激活细胞表面TCR的下调。TCR介导的下游信号通路增强。
并且,DENND1B敲除后,抗原(TNP-OVA)处理会导致淋巴结增大,支气管和肺部组织中各类炎性细胞数目发生上调,抗体含量和炎性因子IL-4、IL-5、IL-13发生上调。
人类中,DENND1B基因C/C(rs2786098)的人群,同样也存在TH2细胞炎性因子表达上调,TCR下调延迟的现象。且炎性因子的表达与DENND1B成正比。
可见,从细胞、动物、临床三个方面看,DENND1B缺失,上调TH2免疫调节功能,导致过敏反应的产生。
DENND1B到底是通过什么方式影响Th2细胞的呢?研究人员发现,当敲减AP-2a或Rab-35后,Th2细胞同样发生了炎性因子表达上升,TCR下调延迟等现象。
免疫沉淀实验发现,DENND1B可以和Ap-2a以及Rab-35结合,且TCR激活后,DENND1B和Rab-35结合量更多。可见DENND1B是通过和AP-2a以及Rab-35调节Th2细胞炎性因子表达以及TCR功能的。
研究人员从现有研究基础出发,在DENND1B与哮喘密切相关的前提下,深入研究了DENND1B在过敏反应中的作用机制。
首先构建基因敲除小鼠,基因敲除所带来的免疫系统,表型上的变化;
通过各类细胞的比较和多种方法的使用,发现可能的作用途径;并能在动物水平和临床水平,多维度验证。
难能可贵的是,又从分子水平出发,继续研究了DENND1B的作用方式(大文章都是憋出来的),揭示了DENND1B具体的互作机制。
本篇文章中主要使用了ELISA、流式分析、qRT-PCR、IP、WB、质粒构建等方法,算有点技术难度的也就是敲除小鼠的构建。重点是其研究思路和逻辑结构——严谨而科学,步步推理,步步验证,着重于解决与临床有关的重大科学问题。这和我们国自然标书撰写的思路是完全一致的:具有有广泛意义的科学问题,在方法上实用>先进,能说明科学问题。逻辑清楚,论证过程圆满。
因此,诞生了这篇影响因子32.24的Paper。完全合理。