服务热线
400-611-2850
百替医学是国内首家专注于医学科研咨询及技术服务的公司,专门为临床医生提供科研问题解决方案。
Phone: 400-611-2850
E-mail:: service@100biotech.com
或 在线留言 给我们
1、联系与咨询。
您可通过公司的服务热线400-611-2850和服务邮箱 service@100biotech.com,或者与您联系的百替医学服务人员,告知您的科研服务需求2、签订保密协议,洽谈具体服务内容。
在双方签订合作保密协议后,您可与百替医学科研服务咨询小组进行具体项目沟通;您和百替医学双方明确服务产品需求和具体项目要求;百替医学制作和提交项目实施方案和报价。3、双方签订合同,客户按合同支付费用。
双方对合同服务内容和价格无异议后,签订服务合同。您按合同约定支付费用,并提供必要的实验药品或样品(实验样品的寄送须采用特快专递形式邮寄,有低温要求的、固定要求的,按低温保存、固定防碎方法运输,以确保安全可靠)。4、项目实施,开始为客户提供科研咨询和技术服务。
百替医学按合同方案进行项目实施。项目实施过程中,百替医学项目经理按时与客户反馈及交流信息;百替医学开始为客户提供相关科研咨询和技术服务,并及时按合同将数据、材料、样本、模型等相关信息材料提供给客户。5、分析结果资料,整理提交数据。
百替医学技术团队分析整理数据,总结结论,将完整项目实施报告和数据、图片等相关信息提供给客户,同时根据合同处理相关的实验材料。项目报告内容将包括具体实验方法、步骤、所用试剂、仪器、数据、结果和结论等。6、项目完成,协商进一步合作。
项目完成,客户如有后续科研服务需求,双方协商进一步合作。
你的【史前基因】Make You Crazy!
发布时间:2016-02-13 13:54 文章来源: 作者:
现代人基因中包含古人种的基因(如尼安德特人)。研究人员通过比对28000个电子健康信息发现,这些史前基因,提高了现在人种患抑郁、皮肤病、血栓,以及其他疾病的风险。研究结果昨日发表在顶级期刊《Science》。
50,000年前的邂逅
很久很久以前,解剖意义上的现代人(AMH)离开非洲,来到亚欧大陆开枝散叶。他们遇到了其他大陆的古人种,从此一发不可收拾。。。
化石记录中发现,AMH和数个古人种在时间和空间中都存在重叠。且遗传学研究发现(R. E. Green et al., Science 328, 710–722 (2010) ),现代人种中包含古人种的部分基因,尤其是丹尼索瓦人和尼安德特人。他们的爱情发生在50,000年前,使得现代欧洲人中,包含约1.5%~4%的尼安德特人基因。
史前基因
现代欧洲人基因中尼安德特人基因存在一定的规律,比如在性染色体以及7号染色体q臂中(此染色体大约包含1000~1400个基因,此染色体异常会引起如“威廉斯综合症”的严重遗传病),尼安德特人基因就很少。说明,在特定染色体位置,史前基因很可能会导致不好的后果(S. Sankararaman et al., Nature 507, 354–357 (2014).)。
当然,事情不是绝对的,某些尼安德特人基因对现代人种就非常有利。这来源于他们离开非洲时间较长,适应了欧亚大陆气候、饮食以及一些高纬度疾病(L. Abi-Rached et al., Science 334, 89–94 (2011).)。遗传的选择压力,能够使得现代人对前人基因 “取其精华,去其糟粕” 。
近期有研究指出,基因组个别尼安德特人基因富集区,很有可能在皮肤以及毛发表型,脂代谢等生理过程发挥重要作用。但是传统的研究手段很难准确定位到尼安德特人种来源DNA,很难定义特定史前基因与人种特征的关系,且花费不菲。
大数据与生物信息学
研究人员整合了电子健康记录(EHRs)中的表型数据,将尼安德特人遗传图谱,与现代人个体遗传图谱进行比对。通过电子医疗记录-遗传学网络数据(eMERGE)(美国的一个联合医疗信息网络数据库),研究基因型以及表型特征,综合考量尼安德特人基因在现代人个体特征的表现规律。样本量总计28,416含有欧洲血统的美国人,EHRs系统内1689个疾病相关表型。
为了鉴别尼安德特人等位基因,研究人员使用了6000个最新的尼安德特人全基因图谱,和1000基因组项目(1KG)中现代人序列进行比对,查找基因渗透性。研究人员鉴定出了135,000个尼安德特人渗透基因中存在的单核苷酸多态型SNPs。
利用全基因组复杂特征分析(GCTA),研究人员建立了1495个尼安德特人SNPs和现代人46个高流行性表型之间的关系。排在前面的有抑郁(2.03%)、心肌梗死(1.39%)、部分皮肤病(1.26%)等。
为了揭示史前基因和现代疾病之间的直接关系,研究人员将这1495个SNPs和1152个电子健康记录中的表行数据进行PheWAS分析(PheWAS可以快速大范围的描述关键变异带来的影响,方法可以参照这篇文献:J. C. Denny et al., Nat. Biotechnol. 31, 1102–1110 (2013).)。利用eMERGE数据进行双向的meta数据分析,聚焦单个SNP和表型之间的关系。
信号强度最高的是外显子rs3917862。包含数个基因,与凝血和炎症有关。研究人员发现,尼安德特人等位基因能够显著上调选择素P(SELP)以及基因编码因子5(F5)表达,增加血栓生成的风险。第二相关性的是rs12049593,和硫胺素转运体有关(影响能量代谢)。除此之外,rs11030043,和帕金森相关。
PheWAS分析显示,尼安德特人SNPs似乎在神经/精神性表型中表现的比较活跃,印证了研究中表明的尼安德特人基因对抑郁的影响。