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揭秘!突变在转移性癌症中充当了什么角色?
发布时间:2016-08-19 10:33 文章来源:未知 作者:百替生物
大约95%的癌症死亡都是由癌症转移引起的,如今很多研究人员都将研究焦点转移到了寻找新方法来阻断或杀灭转移性癌细胞,近日一项刊登于国际杂志Nature Genetics上的研究论文中,来自哈佛-麻省理工学院的研究人员利用新一代的测序工具---整个基因组外显子测序和Affymetrix SNP6.0芯片---揭示了癌症尤其是子宫内膜癌转移发生的机制。
子宫内膜癌是第二大常见的引发女性死亡的癌症,并且在子宫内膜癌的手术汇中就可以将原发性肿瘤及腹部转移性肿瘤进行切除,这样就可以同时获得两种类型的肿瘤,因此揭示子宫内膜癌的发生及转移机制显得尤为重要。
文章中研究人员对98份肿瘤活组织样本(包括12个来源于复杂的不完全型增生组织CAH、32个原发子宫内膜瘤组织和54个腹腔转移瘤组织)进行全外显子组测序,并且分析了癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas)的相关数据,目的在于鉴别原发性肿瘤中反复发生的突变。
每当癌细胞获得新的突变,其就会将突变传递给所有的后代细胞,通过在每一种转移性肿瘤中寻找特殊突变,研究者就可以创建一种家族树来描绘癌症的进化历史,大多数的肿瘤细胞转移都来自于单一的原发性肿瘤亚群体细胞,当研究者观察描述每一种肿瘤历史的家族树时,他们发现,癌症的转移明显倾向于在家族树的分支上形成聚集。
研究者们发现49个频发的基因突变,其中21个基因的突变在子宫内膜癌中还未发现。在这21个新的突变基因中,其中一种最频繁的突变基因就是NRIP1,该基因主要介导雌激素受体通路;目前研究者并不清楚NRIP1基因的突变是否会揭示一种治疗上的脆弱性,因为这些频发的基因突变并未在进行过抗雌激素治疗的病人组织中研究过。因此,NRIP1基因突变的特征以及功能需要进一步研究。此外,基因突变异质性的变异率可以指示基因的突变是在肿瘤哪一进程中获得。
研究者发现,特定的常见驱动基因突变实际上会在癌症进化晚些时候发生,通过对来自相同个体机体的多个活组织样本进行测序,他们就可以评估驱动基因中发生的突变是否可以在所有活组织样本中被检测到。比如类似于表观修饰子ARID1A,其在某些活组织样本中可以频繁被检测到。此外本文研究还表明,并不太可能有任何特殊转移性的驱动基因会在主要的癌症转移突变中产生复发性的突变,此前研究者们就认为,癌症转移或许需要获得一定的特性来帮助其完成参与癌细胞转移等复杂的过程。
Gibson说道,本文的研究结果或许也可以帮助有效治疗癌症转移,以及开发出最佳的策略来靶向作用肿瘤中所有细胞的遗传特性。基于当前研究,希望后期可以设计出特殊的药物来阻断癌症的转移。应增加原发瘤的检测区域以及多个转移位点进行突变基因的寻找和鉴定,寻找肿瘤转移的标记物并为其治疗提供靶点。
基于此研究的创新idea:本文中发现的突变基因是否在其他转移瘤中适用;可根据此方法寻找其他肿瘤转移的标记物,以及这些转移相关的基因突变是否是特异性的?如果将这些发生突变的基因进行修饰或者沉默,肿瘤的转移进程是否会被抑制?