RNA测序——推动了心血管疾病的精准医疗

发布时间:2016-10-13 18:00     文章来源:原创     作者:百替生物

        2012年的一项调查表明,全球有1750万人死于心血管疾病,占全球死亡率的三分之一,其中冠状动脉疾病(CADs)和中风高达80%(1410万)以上。该类疾病在临床上极其常见,严重威胁到了人类的健康,是全球亟待解决的健康难题。
        冠心病,指由于脂质代谢不正常,使血液中的脂质沉着在原本光滑的动脉内膜上,促使动脉内膜因脂类物质堆积而形成白色斑块,称为动脉粥样硬化病变。动脉内膜上的斑块会逐渐增多造成动脉腔狭窄,使血流受阻,导致心脏缺血,最终产生心绞痛。
        冠心病是心脏疾病中非常严重的一类疾病。近年来,随着生活水平的不断提高,冠心病的发病率正逐年递增,并且发病年龄也逐渐趋于年轻化。

        全基因组关联研究(GWAS)鉴定了数百个心血管代谢疾病(CMD)的风险位点,但人们对相应基因的调控机制还知之甚少。不过最近,来自美国的研究人员在STARNET项目中对600名冠心病患者的不同组织进行了基因分型和RNA测序,并对GWAS鉴定的心血管代谢疾病风险位点进行单核苷酸多态性(SNPs)分析,结果发现不同组织和心血管代谢疾病共享顺式和反式下游调控基因,且基因与疾病之间并不存在着组织特异性。相比之下,其他GWAS风险位点的调控作用具有组织特异性,如调控血脂位点的一个重要基因是低密度脂蛋白胆固醇和冠状动脉疾病中的PCSK9基因。
        这项研究是STARNET项目中的一部分,该项目首次系统性的对冠心病(CADs)患者的血液、血管和代谢组织进行了RNA序列分析,其结果对人类研究心血管疾病具有重大意义。

        GWAS位点一般位于非编码区,且跨度大,基因间存在着有很多的单核苷酸多态性(SNPs)。这些区域含有丰富的顺式调控元件和表达数量性状位点(eQTLs),这就预示着风险位点主要通过基因调控来影响疾病的发生,但是至今仍不清楚的问题有:这些基因的调控作用是否包含一个或多个基因、基因调控是否作用于于一个或多个组织、不同疾病的风险位点是否共享顺式和反式调控基因等。
        在该项研究中,对来自600名冠心病患者的血液、动脉粥样硬化病变无乳内动脉(MAM)等不同组织进行了基因分型和RNA测序,共鉴定出800万顺式eQTLs,其中有接近一半是单核苷酸多态性基因。

        GWAS鉴定了不少DNA变异位点,但是这仅仅是对CAD等疾病研究的第一步。而STARNET项目所做的研究为进一步探索CAD和其他复杂疾病提供了基础。研究鉴定出了在单一组织或多个组织中发挥功能的致病基因,这些研究数据为CAD、其他心血管代谢疾病和阿尔茨海默症的研究提供了重大意义。
        在STARNET项目中,致病基因与相应致病组织的明确,有助于实现精准医疗和个性化诊断。

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