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lncRNA参与调控邻近基因的表达
发布时间:2016-12-16 17:48 文章来源: 微信平台Medical Research 作者:martin
长链非编码RNA(lncRNA)是一些长度超过200个核苷酸的RNA分子,不编码任何蛋白质。lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音“,不具有任何生物学功能。然而研究发现lncRNA在不同组织和发育阶段的表达具有特异性,说明其具有特定的生物学功能。越来越多的研究表明,lncRNA能在表观遗传、转录及转录后水平上调控基因的表达,参与了X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要的调控过程,与人类疾病的发生、发展和防治都有着密切的联系。
目前,已经发现了数千种lncRNA,有些lncRNA的功能往往与附近基因的表达相关。最近,Broad研究所的科学家们在lncRNA了邻近基因调控机制方面取得了重要的成果,其研究成果发表在《Nature》杂志上。
著名遗传学家、美国科学院院士Eric S. Lander教授的研究团队采用CRISPR/Cas9方法对小鼠细胞系进行了基因敲除,分析了12个产生lncRNA的基因组位点。研究显示,这些位点中有5个位点影响了邻近基因的顺式表达。值得注意的是,这种影响不依赖于lncRNA转录本自身,而是与lncRNA生成过程的启动子活性、转录过程和剪接等过程相关。
此外,这种影响并不仅仅局限于lncRNA上的碱基,还受到了蛋白编码位点的影响,他们发现6个蛋白编码位点中有4个会对附近基因的表达产生影响。这些结果表明,相邻基因间的交流是一个普遍的现象(如lncRNA等),并可能涉及到多种信号调控机制。