众所周知，树突状细胞（DCs）和单核细胞具有多种亚型，在病原体感染、吞噬和抗原呈递中起着重要作用。然而，由于这些细胞亚型的定义和划分通常是通过细胞形态、物理性质、定位、功能、发育起源和=表面标记分子来进行的，使得这些细胞亚型的身份和相互关系尚未被完全了解。为了克服这种固有的有偏向性的细胞鉴定策略，近日，布罗德研究所的研究人员对从健康献血者分离获得的〜2400个细胞进行了单细胞RNA测序，并且富集HLA-DR+细胞系，尝试对DC细胞和单核细胞的分类进行重新鉴别和修订。 在这项研究中，研究人员采用单细胞分析策略和无偏差基因组分类，并结合后续分析和对特定细胞亚型的功能和表型表征，研究人员鉴别出了不同于传统分类的六个DC亚型和四个单核细胞亚型。其中，在10个受试者的所有DC细胞中存在2%至3%的特征性表达AXL、SIGLEC1和SIGLEC6抗原的一类DC细胞，被命名为AS DC。AS DC群体进一步划分为传统定义的浆细胞样DC（pDC）和CD1C+常规DC（cDC）门捕获的两个群体，这种划分可通过横跨cDC样和pDC样基因集合之间的AS DC细胞的基因表达特征得到证实。虽然AS DC与pDC共享特性，但它们更有效地激活T细胞。这一发现促使他们更倾向于将pDCs重新分类为最初描述的具有较弱T细胞增殖诱导能力的“天然干扰素产生细胞（IPC）”。此外，他们还划分了CD1C+ DC亚型中的新细分群体，一个由主要组织相容性复合体II类样基因组定义，另一个由CD14+单核细胞样突出基因组定义；这两类CD1C+ DC亚类都可以通过将CD1C与CD32B，CD36和CD163抗原组合而富集，从而有效地诱导T细胞增殖。 研究人员表示，修订后的分类将使更准确的功能和发育分析以及健康和疾病中的免疫监测。在传统定义的pDC群体中发现AS DC解释了以前分配给pDC的许多cDC属性，强调需要重新讨论pDC的定义。此外，血液cDC祖细胞的发现代表了在血液中易于操作的新的治疗靶标，以及更好的体外DC产生的新来源。虽然目前的研究结果集中在DCs和单核细胞上，但也可以采用类似的策略来构建一个综合的人体免疫细胞图谱。 参考原文： Villani AC, Satija R, Reynolds G, et al. Single-cell RNA-seq reveals new types of human blood dendritic cells, monocytes, and progenitors[J]. Science, 2017, 356(6335).
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单细胞RNA-seq修订DC细胞和单核细胞分型
发布时间：2017-05-12 14:13 文章来源：medical research 作者：walle
众所周知，树突状细胞（DCs）和单核细胞具有多种亚型，在病原体感染、吞噬和抗原呈递中起着重要作用。然而，由于这些细胞亚型的定义和划分通常是通过细胞形态、物理性质、定位、功能、发育起源和=表面标记分子来进行的，使得这些细胞亚型的身份和相互关系尚未被完全了解。为了克服这种固有的有偏向性的细胞鉴定策略，近日，布罗德研究所的研究人员对从健康献血者分离获得的〜2400个细胞进行了单细胞RNA测序，并且富集HLA-DR+细胞系，尝试对DC细胞和单核细胞的分类进行重新鉴别和修订。
在这项研究中，研究人员采用单细胞分析策略和无偏差基因组分类，并结合后续分析和对特定细胞亚型的功能和表型表征，研究人员鉴别出了不同于传统分类的六个DC亚型和四个单核细胞亚型。其中，在10个受试者的所有DC细胞中存在2%至3%的特征性表达AXL、SIGLEC1和SIGLEC6抗原的一类DC细胞，被命名为AS DC。AS DC群体进一步划分为传统定义的浆细胞样DC（pDC）和CD1C+常规DC（cDC）门捕获的两个群体，这种划分可通过横跨cDC样和pDC样基因集合之间的AS DC细胞的基因表达特征得到证实。虽然AS DC与pDC共享特性，但它们更有效地激活T细胞。这一发现促使他们更倾向于将pDCs重新分类为最初描述的具有较弱T细胞增殖诱导能力的“天然干扰素产生细胞（IPC）”。此外，他们还划分了CD1C+ DC亚型中的新细分群体，一个由主要组织相容性复合体II类样基因组定义，另一个由CD14+单核细胞样突出基因组定义；这两类CD1C+ DC亚类都可以通过将CD1C与CD32B，CD36和CD163抗原组合而富集，从而有效地诱导T细胞增殖。
研究人员表示，修订后的分类将使更准确的功能和发育分析以及健康和疾病中的免疫监测。在传统定义的pDC群体中发现AS DC解释了以前分配给pDC的许多cDC属性，强调需要重新讨论pDC的定义。此外，血液cDC祖细胞的发现代表了在血液中易于操作的新的治疗靶标，以及更好的体外DC产生的新来源。虽然目前的研究结果集中在DCs和单核细胞上，但也可以采用类似的策略来构建一个综合的人体免疫细胞图谱。
参考原文：
Villani AC, Satija R, Reynolds G, et al. Single-cell RNA-seq reveals new types of human blood dendritic cells, monocytes, and progenitors[J]. Science, 2017, 356(6335).